<p class="rightTop"></p>
<h1>Hilfe</h1>
<h2>Legenden</h2>
<h3>DNA</h3>
		<code3>
		    <a href="javascript: add ('A')"><img src="images/adenin.png" alt="Adenin" height="32" width="16"></a> <b class="big">Adenin</b><br>
		    <a href="javascript: add ('T')"><img src="images/thymin.png" alt="Thymin" height="32" width="16"></a> <b class="big">Thymin</b><br>
		    <a href="javascript: add ('G')"><img src="images/guanin.png" alt="Guanin" height="32" width="16"></a> <b class="big">Guanin</b><br>
		    <a href="javascript: add ('C')"><img src="images/cytosin.png" alt="Cytosin" height="32" width="16"></a> <b class="big">Cytosin</b>			
		</code3>
<h3>Aminosäuren</h3>
				<code3>
				A.................Ala.................Alanin<br/>
				C.................Cys.................Cystein<br/>
				D.................Asp.................Aspartinsäure<br/>
				E.................Glu.................Glutaminsäure<br/>
				F.................Phe.................Phenylalanin<br/>
				G.................Gly.................Glycin<br/>
				H.................His.................Histidin<br/>
				I.................Ile.................Isoleucin<br/>
				K.................Lys.................Lysin<br/>
				L.................Leu.................Leucin<br/>
				M.................Met.................Methionin<br/>
				N.................Asn.................Asparagin<br/>
				P.................Pro.................Prolin<br/>
				Q.................Gln.................Glutamin<br/>
				R.................Arg.................Arginin<br/>
				S.................Ser.................Serin<br/>
				T.................Thr.................Threonin<br/>
				V.................Val.................Valin<br/>
				W.................Trp.................Tryptophan<br/>
				Y.................Tyr.................Tyrosin<br/>
            _ = Stop<br>
            ? = unbekannt<br>
			   </code3>
<h2>Suche</h2>
<h3>Muster</h3>
 		<p class="rightTxt">Hier können Sie ein bestimmtes Suchmuster eingeben, wonach die Sequenz durchsucht wird. Hierbei ist die Einabe von
	 			regulären Ausdrücken möglich:
	 					  <ol class="rightLst">
	 									<li><b>'.'</b> ein(!) beliebiges Zeichen (Beispiel: AT. als Muster matcht ATG, ATC, ATA, ATT)</li>
	 									<li><b>'.+'</b> ein beliebiges Zeichen, beliebig oft (Beispiel: AT.+ als Muster matcht ATGGG, ATCCC, ATTACA, ...)</li>
	 									<li><b>'.*'</b> kein oder beliebig viele Zeichen (Beispiel: AT.* als Muster matcht ATGCG, AT, ...)</li>
	 									<li><b>'[ ]'</b> Zeichengruppen (Beispiel: AT[AG] matcht ATA, ATG (nicht aber: ATT ATC))</li>
	 									<li><b>'^'</b> verbotenes Zeichen (Beispiel: AT[^TG] als Muster matcht ATA, ATC (nicht aber: ATG, ATT))</li>
	 					  </ol>
	 	</p>
<h2>Sequenz-Vergleich</h2>
<h3>Fenstergöße</h3>
 		<p class="rightTxt">Gibt an, wie das Dotplot gefiltert werden soll! Je höher der Wert um so länger müssen Übereinstimmungen
		sein, damit sie in der Grafik auftauchen. Dafür verschwindet unerwünschtes Rauschen möglicherweise.</p>
<h3>Dotplotzoom</h3>
 		<p class="rightTxt">Legt fest, wie stark das Dotplot in der Ausgabe skaliert wird. Je größer die beiden Sequenzen sind, desto
	 	kleiner sollte die Zoomstufe gewählt werden. Bis ca. 120 Zeichen eignet sich eine Skalierung &gt 3.</p>
<h3>Hinweis!</h3><p class="rightTxt">Trotz Speicheroptimierung ist die maximale Länge der Sequenzen auf 380 Zeichen je
 		Sequenz für das Alignment begrenzt!</p>
<p class="rightBottom"></p>